1997年，武隆县辖10镇26乡，县政府驻巷口镇。 2000年，武隆县辖巷口、桐梓、火炉、江口、羊角、土坎、白马、长坝、鸭江、平桥10个镇；后坪、鱼子、接龙、土地、白果、核桃、泡沟、石桥、贾角山、浩口、文复、黄草、中嘴、黄莺、龙洞、车盘、碑垭、木根、双河、白云、铁矿、东山、赵家、凤来、庙垭、和顺、兴顺、龙坝、石峰、天星、广杨、蒲板、青吉、茶园、送月、中溪36个乡。
2002年4月，撤销白果乡，并将巷口镇的荆竹村、杨柳村、茶坪村、土坎镇的四合村、和顺村，双河乡的仙女村共6个村划出设立仙女山镇。武隆县辖11个镇、35个乡，21个居委会、427个村委会。
2003年12月，重庆市人民政府批复同意武隆县将11个镇、35个乡调整为11个镇、15个乡。
2007年末，武隆县辖26个乡镇：巷口镇、白马镇、江口镇、仙女山镇、鸭江镇、平桥镇、长坝镇、羊角镇、土坎镇、火炉镇、桐梓镇、黄莺乡、庙垭乡、凤来乡、和顺乡、赵家乡、白云乡、铁矿乡、双河乡、石桥乡、文复乡、浩口乡、沧沟乡、后坪乡、接龙乡、土地乡，187个行政村，县城所在地为巷口镇。
2009年，撤销和顺乡，设立和顺镇；撤销石桥、文复、后坪、浩口四乡，分别改为石桥苗族土家族乡、文复苗族土家族乡、后坪苗族土家族乡、浩口苗族仡佬族乡。
截止到2013年，武隆县幅员面积2901.3平方公里，辖26个乡镇：巷口镇、火炉镇、白马镇、江口镇、仙女山镇、鸭江镇、羊角镇、长坝镇、平桥镇、桐梓镇、土坎镇、和顺镇、凤来乡、庙垭乡、石桥乡、双河乡、黄莺乡、沧沟乡、文复乡、土地乡、白云乡、后坪乡、浩口乡、接龙乡、赵家乡、铁矿乡，187个行政村，县城所在地为巷口镇。
巷口镇
巷口镇位于武隆县中部偏南，为县城所在地。幅员面积276.1平方千米。辖21个行政村和8个社区，有170个村民小组和35个居民小组。川湘公路横贯其中。
火炉镇
火炉镇位于武隆县东北部，距县城30千米。幅员面积179.6平方千米。辖14个行政村和1个社区，有112个农业社和2个居民小组。中桐公路过境。
白马镇
白马镇位于武隆县西北部，距县城24千米。幅员面积221.7平方千米。辖10个行政村和4个社区。是武隆县工业重镇、移民大镇，也是市级中心镇之一，国家小城镇建设试点镇。处于乌江港口和（川湘）国道、涪（陵）白（马）公路交会处。
江口镇
江口镇位于武隆县东部，距县城17千米。幅员面积138.5平方千米。辖8个行政村和2个社区。渝怀铁路、319（川湘）国道贯境。
仙女山镇
仙女山镇位于武隆县中北部，距县城20千米。幅员面积278平方千米。辖22个行政村。景点有仙女山国家森林公园、天生三桥、龙水峡地缝等。
鸭江镇
鸭江镇位于武隆县西北部，距县城56千米。幅员面积120.7平方千米。辖9个行政村和1个社区。
羊角镇
羊角镇位于武隆县西北部，距县城14千米。幅员面积110平方千米。辖10个行政村和1个社区。渝怀铁路、319（川湘）国道贯境。
长坝镇
长坝镇位于武隆县西部，距县城38千米。幅员面积104.4平方千米。辖9个行政村和1个社区。319（川湘）国道贯境。
平桥镇
平桥镇位于武隆县西部，距县城69千米。幅员面积73.4平方千米。辖8个行政村和1个社区。南涪铁路、省道石（柱）雷（神庙）公路以及渝湘高速公路过境。
桐梓镇
桐梓镇位于武隆县东北部，距县城80千米。幅员面积100.8平方千米。辖6个行政村和1个社区。有重晶石、莹石等矿产资源。
土坎镇
土坎镇位于武隆县中部，距县城8千米。幅员面积41.3平方千米。辖5个行政村和1个社区。渝怀铁路、319国道、乌江黄金水线贯境。
和顺镇
和顺镇位于武隆县西北部，距县城84千米。幅员面积103.2平方千米。辖9个行政村和1个社区。
凤来乡
凤来乡位于武隆县最西部，距县城80余千米。幅员面积52平方千米。辖6个行政村。旅游资源主要有大石箐寺庙群、四眼坪万亩竹海等。
庙垭乡
庙垭乡位于武隆县西北部，距县城123千米。幅员面积35.9平方千米。辖9个行政村。属纯农业乡之一。
黄莺乡
黄莺乡位于武隆县南部，距县城16千米。幅员面积149.3平方千米。辖辖6个行政村和1个社区。 有白马山、鹰嘴岩、天星寨、七星吊斗、九落凼十三丫、七门洞峡谷、黄泊渡等生态景观资源。
赵家乡
赵家乡位于武隆县西南，距县城50千米。幅员面积60.2平方千米。辖2个行政村 。
白云乡
白云乡位于武隆县西部，距县城57千米。幅员面积40.5平方千米。辖4个行政村。以境内白云山命名。
铁矿乡
铁矿乡位于武隆县西南部，距县城70千米。幅员面积62.7平方千米。辖3个行政村。矿产资源丰富，有铁矿、铝土矿、煤、石棉矿、大理石矿等。
双河乡
双河乡地处武隆县北部，距县城47千米。幅员面积227.8平方千米。辖8个行政村。 武（隆）丰（都）公路贯境。
沧沟乡
沧沟乡位于武隆县东北部，距县城56千米。幅员面积73平方千米。辖5个行政村 。
接龙乡
接龙乡位于武隆县东北部，距县城81千米。幅员面积114.4平方千米。辖3个行政村。为大仙女山环线乡村旅游示范带乡镇。
土地乡
土地乡位于武隆县东北部，距县城59千米。幅员面积75.8平方千米。辖4个行政村。是典型的农业乡 。
石桥苗族土家族乡
石桥苗族土家族乡位于武隆县东南部，距县城38千米。幅员面积102.7平方千米。辖6个行政村和1个社区。 属县旅游开发重点乡镇。
文复苗族土家族乡
文复乡位于武隆县东部，距县城35千米。幅员面积109.9平方千米。辖6个行政村。
后坪苗族土家族乡
后坪苗族土家族乡位于武隆县东北角，距县城108千米。幅员面积87.3平方千米。辖6个行政村 。
浩口苗族仡佬族乡
浩口苗族仡佬族乡位于武隆县东南角，距县城40千米。幅员面积84.5平方千米。辖6个行政村。有朱子溪、石墙、红军渡、化石峡谷等丰富的旅游资源，杨梅、老荫茶等土特产品和丰富的铝土矿。
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